在动物疫病中，病毒病的危害也最为严重，给养殖业带来了巨大的经济损失。与此同时，人畜共患病与新发病毒病的形势依然十分严峻，造成严重的公共危害。
目前最具爆发风险的新发病原体有克里米亚-刚果出血热病毒/新疆出血热、丝状病毒、高致病性新发冠状病毒、拉萨热病毒、尼帕病毒和裂谷热病毒。而最应该充分重视的病原体是基空肯尼亚病毒、发热伴血小板减少综合症病毒和寨卡病毒。
呼吸系统共患病毒包括正黏病毒病和副黏病毒病，其中正黏病毒病常见的有流感、SARS、中东呼吸综合征。副黏病毒病有亨德拉病、尼帕病、梅那哥病、蓝眼病、习曼病、TPMV。神经系统共患病毒病有乙型脑炎、寨卡病、西尼罗河病等。
病毒病的防控是一项非常艰巨的工作，政府、企业、协会以及从业人员要各司其职，做好疫病防控工作。
一是要政府主导，社会参与，全面掌控疫情。要科学决策，制定措施；要群体防控，种源净化，科普宣传；要因地制宜，分类指导，根据不同区域特点，按照动物种类、养殖模式、饲养用途和疫病种类，分病种、分区域、分畜禽实行指导和管理；要突出重点，统筹推进，整合利用动物疫病防控资源，确定国家优先防控病种，突出重点区域、重点环节、重点措施，加强示范推广，统筹推进动物防疫各项工作。
二是要强化检疫，联防联控，掌控进出。强化口岸检疫、常态化本地调查，制定应急防控技术规范，建立健全跨部门协作机制。
三是要加强法制建设，与国际接轨，强大队伍。要理顺兽医管理体系，改革兽医体制机制，与国际兽医管理体系接轨；强化兽医人才队伍与平台建设。四是立足国情，超前应对，防范未然。做到动物疫源疫病监测；加强研究平台建设；做好应对其所致危害的前期研究。
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